ジャンカヌーという言葉の由来ははっきりしていません。パレード参加者がかぶるマスクにちなんでフランス語の「L’inconnu」（未知のものを意味する）から来ているという説や、スコットランド人入植者がパレードについて「十分なジャンク」という意味で言った「junk enow」から来ているという説、あるいは奴隷として西インド諸島に連れてこられた後も人々と祝う権利を要求したアフリカの部族長の名前「John Canoe」から来ているという説もあります。ここタークス・カイコス諸島では、ジャンカヌーは塩の取引中に行われた塩の収穫取引を祝う祭りでした。商船が収穫した塩と交換する品物を運んできたとき、島民は太鼓、鍋、フライパンを叩き、のこぎり、たわし板をこすり、マラカス、カウベルを振り、ほら貝や笛を吹き鳴らして祝いました。